醫療機構（醫院、衛生院、療養院、診所、衛生中心等）污水是指門診、病房、手術室、各類檢驗室、病理解剖室、放射室、洗衣房、太平間等處排出的診療、生活及糞便污水。醫院污水除生活污水外，還含有化學物質、放射性廢水和病原體。因此，必須經過處理后才能排放，特別是新冠病毒、肝炎等傳染病病房排出的污水，須經預消毒后才可與其他污水合并處理。醫院污水來源及成分復雜，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化學污染物和放射性污染等，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染等特征，不經有效處理會成為一條疫病擴散的重要途徑，嚴重污染環境。醫院污水處理采用全過程控制原則，有效去除污水中有毒有害物質，減少處理過程中消毒副產物產生（污泥、廢渣）和控制出水中過高余氯及廢氣消毒處理，保護生態環境安全。